生物有机菌肥是农业深受欢迎的一种肥料，和粪肥同样能够补充有机质，促进团粒结构的形成。但从绿色健康可持续发展方面来讲，生物有机肥更有优势。这是因为生物有机菌肥与粪肥有很多不同之处。
为什么生物有机菌肥比粪肥好？
1、生物有机菌肥比粪肥“”。
两种肥料的区别重点在于“腐熟”和“”。生物有机菌肥：是用动植物残体，各种动物粪便，经过高温发酵工艺化后符合农业部审批的商品生物有机肥执行标准加工而成的一种商品肥料。
粪肥的缺陷有哪些？
一是含盐分较多，容易使土壤盐化。
二是粪肥带有大量的病菌、虫卵，易引发棚室内的病虫害；
三是粪肥养分含量不稳定，不能做到合理补肥。
四是粪肥内若含有害物质、重金属物质时，仅凭借高温发酵不能去除。
过度使用未经化处理的粪便会危害农作物、土壤、地表水和地下水水质。在某些情况下（通常是新鲜粪便）有烧苗现象；大量使用粪便也能引起土壤中溶解盐的积累，使土壤盐分增高，植物生长受影响。据报道，1999年在非洲有31%的牧场因畜禽粪便污染导致土壤发生盐渍化，土壤肥力下降。所以，一般是不建议粪肥直接下地的，使用前需要发酵腐熟化。
生物有机菌肥改良土壤效果更迅速，若是土壤出现了不良状况，使用生物有机菌肥改良比粪肥更加快速。
这是因为生物有机菌肥具有洁净性和完熟性两大特点。生物有机菌肥在制作过程中不仅进行高温杀菌杀虫，通过微生物完全发酵，并且很好地控制氧气和发酵温度，使有机物质充分分解成为直接形成团粒结构的腐殖质等，同时产生的氨基酸和有益代谢产物得以保留。使用后不会产生对作物有影响的物质。
再次，生物有机菌肥肥料养分全面有机肥料不仅含有作物生长发育所必须的大量和微量营养元素，而且含有可供作物直接吸收利用的有机养分和生长刺激素等，生物有机菌肥肥料肥效稳而长所含养分大部分呈有机态，需经矿质化后才能被作物吸收利用。因此，有机肥料基肥可不断分解、释放养分，其肥效。
生物有机菌肥肥料富含有机质，培肥土壤效果显着含有大量的有机胶体，阳离子交换量高。有利于形成良好的土壤结构，长期、大量施用能提高土壤肥力水平，其作用大大优于化学肥料。
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